Der Greisenkopfpapagei gehört zur Gattung der Rotsteißpapageien. Von manchen Autoren – unter anderem dem South American Classification Committee – wird der Greisenkopfpapagei trotz genetischer Unterschiede als Unterart zum Rosenkopfpapagei gestellt. Andere sind der Ansicht, dass die Arten Pionus tumultuosus und P. seniloides einen sehr plastischen Artenkomplex darstellen, in den sie auch P. seniloides stellen.
Im Allgemeinen wird jedoch die Eigenständigkeit der Art nicht bezweifelt.