Invagination ist ein Begriff aus der Biologie und der Medizin. Er wird als Beschreibung für die Einstülpung eines Bestandteils in einen anderen benutzt. Im Einzelnen bezeichnet die Invagination: in der Zellbiologie
Einstülpung der Zellmembran
Einstülpung der Kernmembran
einen Abschnitt der Gastrulation, eines Teils der Embryonalentwicklung
die teleskopartige Einstülpung einzelner Darmabschnitte ineinander, siehe Intussuszeption
Einstülpung der Augenbläschen zum Augenbecher in der Embryonalentwicklung bei Wirbeltieren
in der Kinderheilkunde eine krankhafte Einstülpung eines Darmabschnittes in einen anderen.